Одјељење за институционалну сарадњу и дијаспору врши послове који се односе на међуинституционалну сарадњу у оквиру БиХ и институционалну сарадњу са иностранством; учествује у раду мјешовитих комитета, комисија, радних група и других државних тијела за привредну сарадњу са иностранством; обавља послове који се односе на сарадњу са међународним организацијама, а нарочито на: израду и ажурирање информација о проведеним активностима представника Републике Српске и БиХ у Савјету Европе, те анализу  и извјештавање о испуњавању постпријемних обавеза Босне и Херцеговине према Савјету Европе; прати и анализира налазе садржане у извјештајима мониторинг тимова Савјета Европе о напретку Босне и Херцеговине у испуњавању пострпријемних обавеза; прати активности земаља регије на приступању NATO савезу; прати пројекте које у сарадњи са институцијама Републике Српске проводи ОSCE и сачињава ажуриране информације о проведеним активностима; сарађује са организацијама и институцијама за регионалну сарадњу у земљи и иностранству; сарађује и координира активности са институцијама Републике Српске и БиХ по свим питањима везаним за ресорну надлежност; обавља и друге послове из дјелокруга Министарства.