​Одјељење за предфинансирање пројеката обавља послове који се односе на управљање средствима намијењеним за предфинансирање пројеката који се реализују од стране јединица локалне самоуправе, привредних организација и организација цивилног друштва, а који су суфинансирани од стране међународних и ЕУ донатора; расписивање јавних позива за додјелу средстава; организацију и спровођење поступка предфинансирања у складу са расположивим револвинг средствима; утврђивање критеријума, услова и рокова за додјелу средстава за предфинансирање; разматрање и обраду захтјева; припрему, израду и преглед уговора о предфинансирању; праћење реализације уговора, укључујући контролу испуњавања уговорних обавеза и намјенског коришћења одобрених средстава; праћење поврата револвинг средстава по добијању грант средстава од донатора; израду извјештаја о реализацији предфинансирања и предлагање мјера за унапређење система; сарадњу са другим организационим јединицама Министарства и релевантним институцијама с циљем ефикасног функционисања система предфинансирања; обављају се и други послови из дјелокруга Министарства.