Одјељење за фондове и развојну помоћ ЕУ обавља послове оперативне координације активности министарстава у Влади Републике Српске у циљу обезбјеђења адекватног учешћа Републике Српске у кориштењу средстава које ЕУ ставља на располагање БиХ; сарадње са Дирекцијом за европске интеграције у циљу правовременог и равноправног учешћа Републике Српске у претприступним и приступним фондовима ЕУ; информисања министарстава у Влади Републике Српске, приватног и непрофитног сектора о расположивим програмима помоћи ЕУ; координације активности републичких органа управе око идентификације планирања и програмирања потреба за средствима ЕУ; координације активности око промоције програма/пројеката из Републике Српске, који би се могли финансирати из средстава ЕУ; координације и организовања обука за представнике потенцијалних корисника у циљу квалитетнијег припремања програма / пројеката; презентације нових облика и инструмената помоћи ЕУ који ће бити доступни БиХ/Републици Српској; координације програма подршке изградње капацитета унутар Владе Републике Српске за ЕУ развојну помоћ; успостављања базе података о помоћи ЕУ БиХ/Републици Српској; системског праћења помоћи ЕУ и упознавања Владе Републике Српске о прикупљеним оперативним програмима помоћи; предлагања мјера за побољшање реализације помоћи ЕУ у Републици Српској; анализе и планирања мјера и активности на већој апсорпцији претприступне помоћи БиХ/Републици Српској, те друге послове из дјелокруга Министарства.